#NEXUS 

Begin trees;  [Treefile saved Thu Apr 12 00:07:35 2012]
[!
>Data file = haplo-position.nex
>Heuristic search settings:
>  Optimality criterion = parsimony
>    Character-status summary:
>      Of 331 total characters:
>        6 characters are of type 'ord' (Wagner)
>        325 characters are of type 'unord'
>        All characters have equal weight
>        7 characters are parsimony-uninformative
>        Number of parsimony-informative characters = 324
>    Gaps are treated as "missing"
>    Multistate taxa interpreted as uncertainty
>  Starting tree(s) obtained via stepwise addition
>  Addition sequence: random
>    Number of replicates = 50
>    Starting seed = 1433745830
>  Number of trees held at each step during stepwise addition = 1
>  Branch-swapping algorithm: tree-bisection-reconnection (TBR)
>  Steepest descent option not in effect
>  Initial 'MaxTrees' setting = 500000
>  Branches collapsed (creating polytomies) if maximum branch length is zero
>  'MulTrees' option in effect
>  Keeping only trees compatible with constraint-tree "apatosaurus"
>  Trees are unrooted
>
>Heuristic search completed
>   Total number of rearrangements tried = 3650211
>   Score of best tree(s) found = 817
>   Number of trees retained = 24
>   Time used = 2.30 sec
]
	Translate
		1 Prosauropoda,
		2 Theropoda,
		3 Vulcanodon,
		4 Barapasaurus,
		5 Omeisaurus,
		6 Shunosaurus,
		7 Patagosaurus,
		8 Mamenchisaurus,
		9 Apatosaurus,
		10 Barosaurus,
		11 B_altithorax,
		12 B_brancai,
		13 Camarasaurus,
		14 Dicraeosaurus,
		15 Diplodocus,
		16 Haplocanthosaurus,
		17 Amargasaurus,
		18 Euhelopus,
		19 Jobaria,
		20 Malawisaurus,
		21 Nigersaurus,
		22 Limaysaurus,
		23 Rebbachisaurus,
		24 Alamosaurus,
		25 Nemegtosaurus,
		26 Opisthocoelicaudia,
		27 Rapetosaurus,
		28 Saltasaurus,
		29 Isisaurus,
		30 Losillasaurus,
		31 Suuwassea
		;
tree PAUP_1 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):7,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):20,((14:8,17:10):12,31:6):12):25,(21:3,(22:1,23:1):2):20):52,(((11:6,12:3):14,(18:13,(20:9,(((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):17,(25:0,29:0):10):19):20):53):21,13:9):16):10,19:6):21):16,8:15):13,5:8):37,6:7):21):90);
tree PAUP_2 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):7,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):20,((14:8,17:10):12,31:6):12):25,((21:0,23:0):4,22:3):20):52,(((11:6,12:3):14,(18:13,(20:9,(((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):17,(25:0,29:0):10):19):20):53):21,13:9):16):10,19:6):21):16,8:15):13,5:8):37,6:7):21):90);
tree PAUP_3 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):7,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):20,((14:8,17:10):12,31:6):12):25,((21:3,22:3):0,23:1):20):52,(((11:6,12:3):14,(18:13,(20:9,(((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):17,(25:0,29:0):10):19):20):53):21,13:9):16):10,19:6):21):16,8:15):13,5:8):37,6:7):21):90);
tree PAUP_4 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):6,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):21,((14:8,17:10):12,31:6):11):25,(21:3,(22:1,23:1):2):20):53,((11:3,(12:13,(18:13,(20:9,(((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):17,(25:0,29:0):10):19):20):57):3):22,13:9):16):9,19:6):21):16,8:15):13,5:9):36,6:7):21):90);
tree PAUP_5 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):7,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):20,((14:8,17:10):12,31:6):12):25,(21:3,(22:1,23:1):2):20):52,(((11:6,12:3):14,(18:13,(20:9,((((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):7,29:6):10,25:4):19):20):53):21,13:9):16):10,19:6):21):16,8:15):13,5:8):37,6:7):21):90);
tree PAUP_6 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):7,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):20,((14:8,17:10):12,31:6):12):25,(21:3,(22:1,23:1):2):20):52,(((11:6,12:3):14,(18:13,(20:6,(((24:11,((26:14,28:10):5,29:9):8):18,27:24):10,25:4):21):22):53):21,13:9):16):10,19:6):21):16,8:15):13,5:8):37,6:7):21):90);
tree PAUP_7 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):7,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):20,((14:8,17:10):12,31:6):12):25,(21:3,(22:1,23:1):2):20):52,(((11:6,12:3):14,(18:13,(20:9,((((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):10,25:4):7,29:6):19):20):53):21,13:9):16):10,19:6):21):16,8:15):13,5:8):37,6:7):21):90);
tree PAUP_8 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):6,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):21,((14:8,17:10):12,31:6):11):25,((21:0,23:0):4,22:3):20):53,((11:3,(12:13,(18:13,(20:9,(((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):17,(25:0,29:0):10):19):20):57):3):22,13:9):16):9,19:6):21):16,8:15):13,5:9):36,6:7):21):90);
tree PAUP_9 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):7,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):20,((14:8,17:10):12,31:6):12):25,((21:0,23:0):4,22:3):20):52,(((11:6,12:3):14,(18:13,(20:9,((((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):7,29:6):10,25:4):19):20):53):21,13:9):16):10,19:6):21):16,8:15):13,5:8):37,6:7):21):90);
tree PAUP_10 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):7,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):20,((14:8,17:10):12,31:6):12):25,((21:0,23:0):4,22:3):20):52,(((11:6,12:3):14,(18:13,(20:6,(((24:11,((26:14,28:10):5,29:9):8):18,27:24):10,25:4):21):22):53):21,13:9):16):10,19:6):21):16,8:15):13,5:8):37,6:7):21):90);
tree PAUP_11 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):7,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):20,((14:8,17:10):12,31:6):12):25,((21:0,23:0):4,22:3):20):52,(((11:6,12:3):14,(18:13,(20:9,((((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):10,25:4):7,29:6):19):20):53):21,13:9):16):10,19:6):21):16,8:15):13,5:8):37,6:7):21):90);
tree PAUP_12 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):6,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):21,((14:8,17:10):12,31:6):11):25,((21:3,22:3):0,23:1):20):53,((11:3,(12:13,(18:13,(20:9,(((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):17,(25:0,29:0):10):19):20):57):3):22,13:9):16):9,19:6):21):16,8:15):13,5:9):36,6:7):21):90);
tree PAUP_13 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):7,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):20,((14:8,17:10):12,31:6):12):25,((21:3,22:3):0,23:1):20):52,(((11:6,12:3):14,(18:13,(20:9,((((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):7,29:6):10,25:4):19):20):53):21,13:9):16):10,19:6):21):16,8:15):13,5:8):37,6:7):21):90);
tree PAUP_14 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):7,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):20,((14:8,17:10):12,31:6):12):25,((21:3,22:3):0,23:1):20):52,(((11:6,12:3):14,(18:13,(20:6,(((24:11,((26:14,28:10):5,29:9):8):18,27:24):10,25:4):21):22):53):21,13:9):16):10,19:6):21):16,8:15):13,5:8):37,6:7):21):90);
tree PAUP_15 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):7,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):20,((14:8,17:10):12,31:6):12):25,((21:3,22:3):0,23:1):20):52,(((11:6,12:3):14,(18:13,(20:9,((((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):10,25:4):7,29:6):19):20):53):21,13:9):16):10,19:6):21):16,8:15):13,5:8):37,6:7):21):90);
tree PAUP_16 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):6,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):21,((14:8,17:10):12,31:6):11):25,(21:3,(22:1,23:1):2):20):53,((11:3,(12:13,(18:13,(20:9,((((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):7,29:6):10,25:4):19):20):57):3):22,13:9):16):9,19:6):21):16,8:15):13,5:9):36,6:7):21):90);
tree PAUP_17 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):6,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):21,((14:8,17:10):12,31:6):11):25,(21:3,(22:1,23:1):2):20):53,((11:3,(12:13,(18:13,(20:6,(((24:11,((26:14,28:10):5,29:9):8):18,27:24):10,25:4):21):22):57):3):22,13:9):16):9,19:6):21):16,8:15):13,5:9):36,6:7):21):90);
tree PAUP_18 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):6,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):21,((14:8,17:10):12,31:6):11):25,(21:3,(22:1,23:1):2):20):53,((11:3,(12:13,(18:13,(20:9,((((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):10,25:4):7,29:6):19):20):57):3):22,13:9):16):9,19:6):21):16,8:15):13,5:9):36,6:7):21):90);
tree PAUP_19 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):6,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):21,((14:8,17:10):12,31:6):11):25,((21:0,23:0):4,22:3):20):53,((11:3,(12:13,(18:13,(20:9,((((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):7,29:6):10,25:4):19):20):57):3):22,13:9):16):9,19:6):21):16,8:15):13,5:9):36,6:7):21):90);
tree PAUP_20 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):6,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):21,((14:8,17:10):12,31:6):11):25,((21:0,23:0):4,22:3):20):53,((11:3,(12:13,(18:13,(20:6,(((24:11,((26:14,28:10):5,29:9):8):18,27:24):10,25:4):21):22):57):3):22,13:9):16):9,19:6):21):16,8:15):13,5:9):36,6:7):21):90);
tree PAUP_21 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):6,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):21,((14:8,17:10):12,31:6):11):25,((21:0,23:0):4,22:3):20):53,((11:3,(12:13,(18:13,(20:9,((((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):10,25:4):7,29:6):19):20):57):3):22,13:9):16):9,19:6):21):16,8:15):13,5:9):36,6:7):21):90);
tree PAUP_22 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):6,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):21,((14:8,17:10):12,31:6):11):25,((21:3,22:3):0,23:1):20):53,((11:3,(12:13,(18:13,(20:9,((((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):7,29:6):10,25:4):19):20):57):3):22,13:9):16):9,19:6):21):16,8:15):13,5:9):36,6:7):21):90);
tree PAUP_23 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):6,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):21,((14:8,17:10):12,31:6):11):25,((21:3,22:3):0,23:1):20):53,((11:3,(12:13,(18:13,(20:6,(((24:11,((26:14,28:10):5,29:9):8):18,27:24):10,25:4):21):22):57):3):22,13:9):16):9,19:6):21):16,8:15):13,5:9):36,6:7):21):90);
tree PAUP_24 = [&U] (1:3,2:4,(3:5,(((((4:3,(7:0,30:13):6):6,((((((9:5,16:36):4,(10:4,15:3):11):21,((14:8,17:10):12,31:6):11):25,((21:3,22:3):0,23:1):20):53,((11:3,(12:13,(18:13,(20:9,((((24:10,(26:14,28:10):10):14,27:29):10,25:4):7,29:6):19):20):57):3):22,13:9):16):9,19:6):21):16,8:15):13,5:9):36,6:7):21):90);
End;